小堀 哲生 

所属部署分子化学系
職名教授
Last Updated :2021/09/17

プロフィール

取得学位

  • 修士(理学), 東京工業大学, 1999年03月
  • 博士(理学), 東京工業大学, 2002年03月

職歴(学外)

  • 2002年04月~2004年09月, 独立行政法人科学技術振興機構, 博士研究員
  • 2009年03月~2010年03月, Stanford University, Visiting Scholar
  • 職歴(学内)

  • 2004年10月~2007年03月, 京都工芸繊維大学, 助手
  • 2007年04月~2009年02月, 京都工芸繊維大学, 助教
  • 2009年03月~2019年01月, 京都工芸繊維大学, 准教授
  • 2019年02月~, 京都工芸繊維大学, 教授
  • 研究室ホームページ

    教育活動

    担当授業

    • 生化学Ⅲ
    • 機能分子化学Ⅰ
    • 生体制御分子設計
    • 生体分子設計学

    シラバス

    『シラバスシステムへのリンク』

    研究活動

    研究分野

    所属学会

      日本化学会, 生体機能関連化学部会, アメリカ化学会, 新世代の生物有機化学研究会, 日本核酸医薬学会, 日本核酸化学会, 日本分光学会

    論文

    • Dual-fluorescent RNA probes with an extremely large stokes shift
      著者名 : 小堀 哲生, Takako Ueda, Yuya Sanada, Asako Yamayoshi, Akira Murakami
      掲載誌名 : Biosci. Biotechnol. Biochem.
      出版年月 : 2013年05月
      巻・号・頁 : 77,5,1117-1119
    • Rate-adjusted cross-linking reaction by photoresponsive ?-bromoaldehyde(PBA)-conjugated ODN
      著者名 : Akio Kobori, Nagae Y, Sugihara X, Asako Yamayoshi, Akira Murakami
      掲載誌名 : Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters
      出版年月 : 2013年01月
      巻・号・頁 : 3,5825?5828
    • 4N-(4,5',8-trimethylpsoralen-4’-ylmethyl)-2’-deoxycytosine-containing oligodeoxyribonucleotides
      著者名 : Akio Kobori, Tomita Kohji, Nagae Yuko, Yamayoshi Asako, Murakami Akira
      掲載誌名 : Chemistry Letters
      出版年月 : 2012年08月
      巻・号・頁 : 41,804-805
    • Novel photoresponsive cross-linking oligodeoxyribonucleotides having a caged "alpha"-chloroaldehyde
      著者名 : Akio Kobori, Takemune Yamauchi, Yuko Nagae, Asako Yamayoshi, Akira Murakami
      掲載誌名 : Biorganic Medicinal Chemistry
      出版年月 : 2012年08月
      巻・号・頁 : 20,5071-5076
    • RNA-based diagnosis in a multicellular specimen by whole mount in situ hybridization using an RNA-specific probe
      著者名 : TAKAKO UEDA, AKIO KOBORI, ASAKO YAMAYOSHI, HIDEKI YOSHIDA, MASAMITSU YAMAGUCHI, AKIRA MURAKAMI
      掲載誌名 : Bioorganic & Medicinal Chemistry
      出版年月 : 2012年08月
      巻・号・頁 : 20巻20号6034頁
    • Surprising Repair Activities of Nonpolar Analogs of 8-oxoG Expose Features of Recognition and Catalysis by Base Excision Repair Glycosylases
      著者名 : Paige L. McKibbin, 小堀 哲生, Yosuke Taniguchi, Eric T. Kool, Sheila S. David
      掲載誌名 : Journal of the american chemical society
      出版年月 : 2012年01月
      巻・号・頁 : 134,1653-1661
    • Structural insights for design of inhibitors against RISC function.
      著者名 : Asako Yamayoshi, Yamada Y., Akio Kobori, Akira Murakami
      掲載誌名 : Chem. Lett.
      出版年月 : 2012年01月
      巻・号・頁 : 41, 1684-1685
    • Synthesis and cross-linking activity of 4-N-(4,5’,8-trimethylpsoralen-4-ylmethyl)-2’-deoxycytidine-containing oligodeoxyribonucleotides.
      著者名 : Akio Kobori, Tomita K., Nagae Y., Asako Yamayoshi, Akira Murakami
      掲載誌名 : Chem. Lett.
      出版年月 : 2012年01月
      巻・号・頁 : 41, 804-5
    • Decoy-DNA Against Special AT-Rich Sequence Binding Protein 1 Inhibits the Growth and Invasive Ability of Human Breast Cancer
      著者名 : A.Yamayoshi, M.Yasuhara, S.Galande, A.Kobori, A.Murakami
      掲載誌名 : Oligonucleotides
      出版年月 : 2011年01月
      巻・号・頁 : Vol.21, No.2, 115-121
    • Development of a system to sensitively and specifically visualize c-fos
      著者名 : Reiko Waki, A.Yamayoshi, A.Murakami, A.Kobori
      掲載誌名 : Chem. Commun
      出版年月 : 2011年01月
      巻・号・頁 : 47, 4204-4206
    • Real-time imaging of RNA expression in living cells using
      著者名 : R.Waki, A.Yamayoshi, A.Murakami, A.Kobori
      掲載誌名 : Chem. Lett.
      出版年月 : 2011年01月
      巻・号・頁 : in press
    • Specific Regulation of Point-Mutated K-ras-Immortalized Cell Proliferation by a Photodynamic Antisense Strategy
      著者名 : Maiko Higuchi, Asako Yamayoshi, Kiyoko Kato, Akio Kobori, Norio Wake, Akira Murakami
      掲載誌名 : Oligonucleotides
      出版年月 : 2010年02月
      巻・号・頁 : Vol.20, No.1, 37-43
    • Sequence selective formation of 1,N(6)-ethenoadenine in DNA by furan-conjugated probe.
      著者名 : 小堀哲生, 森田淳平, 山吉麻子, 村上 章
      掲載誌名 : Bioorg Med Chem Lett.
      出版年月 : 2009年07月
      巻・号・頁 : 19(13):3657-60, 2009
    • Synthesis and photo-induced cross-linking reactions of 4,5',8-trimethyl-psoralen-incorporated oligodeoxyribonucleotide
      著者名 : Akio Kobori, Kazutaka Takaya, Maiko Higuchi, Asako Yamayoshi, Akira Murakami
      掲載誌名 : Chem. Lett.
      出版年月 : 2009年01月
      巻・号・頁 : 38(3): 272-273
    • Synthesis of antisense oligonucleotides containing 2'-O-psoralenylmethoxyalkyl adenosine for photodynamic regulation of point mutations in RNA
      著者名 : Maiko Higuchi, Akio Kobori, Asako Yamayoshi, Akira Murakami
      掲載誌名 : Bioorg Med Chem.
      出版年月 : 2009年01月
      巻・号・頁 : 17(2): 475-83.
    • Dimer of 2,7-Diamino-1,8-naphthyridine for the Detection of Mismatches Formed by Pyrimidine Nucleotide Bases
      著者名 : 小堀 哲生, 中谷和彦
      掲載誌名 : Bioorganic Medicinal Chemistry
      出版年月 : 2008年12月
      巻・号・頁 : 16,10338-10344
    • Efficient synthesis of functionalized oligodeoxyribonucleotides with base-labile groups using a new silyl linker
      著者名 : A. Ohkubo, R. Kasuya, K. Aoki, A. Kobori, M. Sekine
      掲載誌名 : Bioorganic Medicinal Chemistry
      出版年月 : 2008年06月
      巻・号・頁 : 16 5345-5351
    • Microarray-based label-free detection of RNA using bispyrene-modified 2'-O-methyl oligoribonucleotide as capture and detection probe.
      著者名 : Akira Murakami, Akio Kobori, Takashi Sakamoto
      掲載誌名 : Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters
      出版年月 : 2008年04月
      巻・号・頁 : 18, 2590-2593, 2008
    • Naphthyridine-tethered Oligonucleotides: Dye/DNA Conjugates for Homogeneous SNPs Assays
      著者名 : Akio Kobori, Takashi Mori, Makoto Ubayashi, Akira Murakami
      掲載誌名 : Chemistry Letters
      出版年月 : 2008年02月
      巻・号・頁 : 37, 3, 354-355
    • Homogeneous fluorescence assays for RNA-diagnosis by pyrene-conjugated 2’-O-methyl- oligoribonucleotides.
      著者名 : Takashi Sakamoto,, Masako Shigesawa, Yasutaka Amitani, Maiko Higuchi, Akira Murakami, Akio Kobori
      掲載誌名 : Nucleosides, Nucleotides, & Nucleic Acids
      出版年月 : 2007年12月
      巻・号・頁 : 26, 1659-1664
    • Analysis of mismatched DNA by mismatch binding ligand (MBL)?Sepharose affinity chromatography
      著者名 : Y. Goto, H. Suda, 小堀哲生, K. Nakatani
      掲載誌名 : Anal. Bioanal. Chem.
      出版年月 : 2007年07月
      巻・号・頁 : 388, 1165-1173
    • Allele Specific C-Bulge Probes with One Unique Fluorescent Molecule Discriminate the Single Nucleotide Polymorphism in DNA
      著者名 : F. Takei, H. Suda, J. Zhang, 小堀哲生, K. Nakatani
      掲載誌名 : Chem. Eur. J.
      出版年月 : 2007年05月
      巻・号・頁 : 13, 4452-4457
    • Selective Photo-Cross-Linking of 2'-O-Psoralen-Conjugated Oligonucleotide with RNAs Having Point Mutations.
      著者名 : Maiko Higuchi, Asako Yamayoshi, T. Yamaguchi, R. Iwase, Akio Kobori, T. Yamaoka, Akira Murakami
      掲載誌名 : Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids
      出版年月 : 2007年03月
      巻・号・頁 : 26, 277-290
    • Detection of L-DNA-tagged PCR products by surface plasmon resonance imaging
      著者名 : 林剛介, 萩原, 小堀哲生, 中谷 和彦
      掲載誌名 : Chembiochem
      出版年月 : 2007年01月
      巻・号・頁 : 22, 169-171
    • Evaluation of mismatch-binding ligands as inhibitors for Rev-RRE interaction
      著者名 : K. Nakatani, S. Horie, Y. Goto, 小堀哲生, S. Hagihara
      掲載誌名 : Bioorg. Med. Chem.
      出版年月 : 2006年08月
      巻・号・頁 : 14, 5384-5388
    • Conformational studies of 4-N-carbamoyldeoxycytidine derivatives and synthesis and hybridization properties of oligodeoxyribonucleotides incorporating these modified bases
      著者名 : K. Miyata, 小堀哲生, R. Tamamushi, A. Ohkubo, H. Taguchi, K. Seio, M. Sekine
      掲載誌名 : Eur. J. Org. Chem.
      出版年月 : 2006年04月
      巻・号・頁 : 16, 3626-3637
    • Synthesis of antisense oligonucleotides containing a photocleavable protecting group on a guanine base and their photoinduced duplex formation
      著者名 : Reiko Iwase, Udai Fukui, Akio Kobori, Tetsuji Yamaoka, and Akira Murakami
      掲載誌名 : Nucleic Acids Symp Ser
      出版年月 : 2005年11月
      巻・号・頁 : 49, 151-152
    • Luminescence anisotropy-based detection of nucleic acids and proteins using long-lifetime Ru(II) complex as a luminescent label
      著者名 : Takashi Sakamoto, Atsushi Mahara, Kobori Akio, Tetsuji Yamaoka, and Akira Murakami
      掲載誌名 : Nucleic Acids Symp Ser
      出版年月 : 2005年11月
      巻・号・頁 : 49, 203-204
    • The destabilization of polyplexes facilitates intranuclear transcription efficiency
      著者名 : Tomoko Hashimoto, Akio Kobori, Akira Murakami, and Tetsuji Yamaoka
      掲載誌名 : Nucleic Acids Symp Ser
      出版年月 : 2005年11月
      巻・号・頁 : 49, 365-366
    • Solution structure of a small-molecular ligand complexed with CAG trinucleotide repeat DNA
      著者名 : Kazuhiko Nakatani, Shinya Hagihara, Yuki Goto, Akio Kobori, Masaki Hagihara, Gosuke Hayashi, Motoki Kyo, Makoto Nomura, Masaki Mishima, and Chojiro Kojima
      掲載誌名 : Nucleic Acids Symposium Series
      出版年月 : 2005年11月
      巻・号・頁 : 2005,49,49-50
    • Synthesis and properties of photo-reactive antisense oligonucleotides containing 2'-O-psoralen-conjugated adenosine
      著者名 : Maiko Higuchi, Asako Yamayoshi, Akio Kobori, Tetsuji Yamaoka, and Akira Murakami
      掲載誌名 : Nucleic Acids Symp Ser
      出版年月 : 2005年11月
      巻・号・頁 : 49, 331-332
    • N,N'-Bis(3^aminopropyl-2,7-diaminonaphthyridine stabilized a single pyrimidine bulge in duplex DNA.
      著者名 : Hitoshi Suda, Akio Kobori, Jinhua Zhang, Gosuke Hayashi and Kazuhiko Nakatani
      掲載誌名 : Bioorg. Med. Chem.
      出版年月 : 2005年07月
      巻・号・頁 : 13,(14), 4507-4512.
    • Small-molecule ligand induces nucleotide flipping in(CAG)n trinucleotide repeats
      著者名 : Kazuhiko, Nakatani; Shinya, Hagihara; Yuki, Goto; Akio, Kobori; Masaki, Hagihara; Gosuke, Hayashi; Motoki, Kyo; Makoto, Nomura; Masaki, Mishima; Chojiro, Kojima.
      掲載誌名 : Nature Chemical Biology
      出版年月 : 2005年00月
      巻・号・頁 : in press
    • A new ligand binding to G?G mismatch having improved thermal and alkaline stability
      著者名 : Tao, Peng; Takashi, Murase; Yuki, Goto; Akio, Kobori; Kazuhiko, Nakatani.
      掲載誌名 : Bioorg. Med. Chem. Lett.
      出版年月 : 2005年00月
      巻・号・頁 : 15,259-262
    • SPR fingerprinting of mismatched base pair
      著者名 : Akio Kobori, Tao Peng Gosuke Hayashi, Kazuhiko Nakatani
      掲載誌名 : Nucleic Acids Res. Symposium ser.
      出版年月 : 2004年11月
      巻・号・頁 : 48, 129-130
    • 精密ゲノム遺伝子解析法を指向した新技術の展開
      著者名 : 関根光雄、大窪章寛、岡本至、小堀哲生、清尾康志
      掲載誌名 : 蛋白質 核酸 酵素
      出版年月 : 2004年00月
      巻・号・頁 : 49, 17,2978-2985
    • 2-Ureidoquinoline : a useful molecular element for stabilizing single cytosine and thymine bulges.
      著者名 : Akio, Kobori; Takashi, Murase; Hitoshi, Suda; Isao, Saito; Kazuhiko, Nakatani.
      掲載誌名 : Bioorg. Med. Chem. Lett.
      出版年月 : 2004年00月
      巻・号・頁 : 14、3431-3433
    • Detection of guanine-adenine mismatches by surface plasmon resonance sensor carrying naphthyridine-azaquinolone hybrid on the surface.
      著者名 : Shinya, Hagihara; Hiroyuki, Kumasawa; Yuki, Goto; Gosuke, Hayashi; Akio, Kobori; Kazuhiko, Nakatani
      掲載誌名 : Nucleic Acids Res.
      出版年月 : 2004年00月
      巻・号・頁 : 32,278-286
    • Highly sensitive detection of GG mismatched DNA by surfaces immobilized naphthyridine dimer through poly(ethylene oxide) linker.
      著者名 : Kazuhiko, Nakatani; Akio, Kobori; Hiroyuki, Kumasawa; Isao, Saito.
      掲載誌名 : Bioorg. Med. Chem. Lett.
      出版年月 : 2004年00月
      巻・号・頁 : 14,1105-1108
    • Separation of mismatched DNA by using the affinity column immobilizing mismatch-binding ligands
      著者名 : Yuki Goto, Akio Kobori, Hitoshi Suda, Kazuhiko Nakatani
      掲載誌名 : Nucleic Acids Res. Symposium ser.
      出版年月 : 2004年00月
      巻・号・頁 : 48, 123-124
    • The SPR sensor Detection Cytosine-Cytosine mismatches
      著者名 : Akio, Kobori; Souta, Horie; Hitoshi, Suda; Isao, Saito; Kazuhiko, Nakatani.
      掲載誌名 : J. Am. Chem. Soc.
      出版年月 : 2004年00月
      巻・号・頁 : 126、557-562
    • The Binding of Guanine-Guanine Mismatched DNA to Naphthyridine Dimer Immobilized Sensor Surfaces: Kinetic Aspects
      著者名 : Kazuhiko, Nakatani; Akio, Kobori; Hiroyuki, Kumasawa; Yuki, Goto; Isao, Saito
      掲載誌名 : Bioorg. Med. Chem.
      出版年月 : 2004年00月
      巻・号・頁 : 12,3117-3123
    • Dual-fluorescent RNA probes with extremely large Stokes shifts.
      著者名 : 村上 章, 小堀 哲生, 上田 貴子, 真田, 山吉 麻子
      掲載誌名 : Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
      出版年月 : 2003年01月
      巻・号・頁 : 77(5):1117-1119
    • 2,6-diaminonaphthyridine derivatives bind to a single nucleotide bulge in DNA.
      著者名 : Hitoshi, Suda; Shinya, Hagihara; Akio, Kobori; Kazuhiko, Nakatani
      掲載誌名 : Nucleic Acids Res. Supplement
      出版年月 : 2003年00月
      巻・号・頁 : 3, 139-140
    • The binding of naphthyridine tetramer to guanine-rich sequences.
      著者名 : Yuki, Goto; Shinya, Hagihara; Akio, Kobori; Kazuhiko, Nakatani; Isao, Saito
      掲載誌名 : Nucleic Acids Res. Supplement
      出版年月 : 2003年00月
      巻・号・頁 : 3, 133-134
    • Detection of the C-C mismatched base pair by small ligands
      著者名 : Akio, Kobori; Hitoshi, Suda; Kazuhiko, Nakatani; Isao, Saito.
      掲載誌名 : Nucleic Acids Res. Supplement
      出版年月 : 2003年00月
      巻・号・頁 : 3, 131-132
    • Unique participation of unprotected internucleotidic phosphodiester residues on unexpected cleavage reaction of the Si - O bond of the diisopropylsilandiyl group used as a linker for the solid-phase synthesis of 5'-terminal guanylated oligodeoxynucleotides
      著者名 : Masatoshi, Ushioda; Michinori, Kadokura; Tomohisa, Moriguchi; Akio, Kobori; Morihiro, Aoyagi; Kohji, Seio; Mitsuo, Sekine.
      掲載誌名 : Helv. Chim. Acta
      出版年月 : 2002年00月
      巻・号・頁 : 85, 2930-2945
    • A New Method for the Synthesis of Oligodeoxyribonucleotides Containing 4-N-Alkoxycarbonyldeoxycytidine Derivatives and Their Hybridization Properties.
      著者名 : Akio, Kobori; Kenichi, Miyata; Masatoshi, Ushioda; Kohji, Seio; Mitsuo, Sekine
      掲載誌名 : J. Org. Chem.
      出版年月 : 2002年00月
      巻・号・頁 : 67, 476-485
    • Hybridization ability and base pair geometry of modified deoxycytidine derivatives having a 4-N-carbamoyl group.
      著者名 : 12. Kenichi Miyata, Akio Kobori, Kohji Seio, Mitsuo Sekine.
      掲載誌名 : Nucleic Acids Res. Supplement
      出版年月 : 2002年00月
      巻・号・頁 : 2, 161-162
    • A new silyl ether-type linker useful for the automated synthesis of oligonucleotides having base-labile protective groups.
      著者名 : Akio, Kobori; Kenichi, Miyata; Masatoshi, Ushioda; Kohji, Seio; Mitsuo, Sekine.
      掲載誌名 : Chem. Lett
      出版年月 : 2002年00月
      巻・号・頁 : 1, 16-17
    • Synthesis and hybridization ability of oligodeoxyribonucleotides incorporating N-acyldeoxycytidine derivatives.
      著者名 : Takeshi, Wada; Akio, Kobori; Shun-Ichi, Kawahara; Mitsuo, Sekine.
      掲載誌名 : Eur. J. Org. Chem.
      出版年月 : 2001年00月
      巻・号・頁 : 4583-4593
    • Theoretical study of the hydrogen bond energy of base pairs formed between substituted 1-methylcytosine derivatives and 9-methylguanine.
      著者名 : Shun-Ichi, Kawahara; Akio, Kobori; Mitsuo, Sekine; Kazunari, Taira; Tadafumi, Uchimaru.
      掲載誌名 : J. Phys. Chem. A
      出版年月 : 2001年00月
      巻・号・頁 : 105, 10596-10601
    • Ab initio molecular orbital evaluation of the hydrogen bond energy of base pairs formed between substituted 1-methylcytosine derivatives and 9-methylguanine.
      著者名 : Shun-ichi Kawahara, Akio Kobori, Kazunari Taira, Mitsuo Sekine, Tadafumi Uchimaru.
      掲載誌名 : Nucleic Acids Research supplement
      出版年月 : 2001年00月
      巻・号・頁 : 1, 29-30

    著書等

    • Photodynamic antisense regulation of mRNA having a point mutation with psoralen-conjugated oligonucleotide
      著者名 : Akio Kobori
      出版年月 : 2008年12月
    • Selective regulation of mutant K-ras mRNA expression by photo-cross-linking antisense oligonucleotide
      著者名 : A.Kobori
      出版年月 : 2007年11月
    • Synthesis of naphthyridine-conjugated DNA probes and their application to SNPs typing
      著者名 : A.Kobori
      出版年月 : 2007年11月
    • Gene regulation by decoy approach (II): Development of photo-cross-linked oligonucleotides duplex as a decoy DNA for estrogen receptor
      著者名 : A.Kobori
      出版年月 : 2007年11月
    • 新しいDNAチップの科学と応用:時間をキーワードとした遺伝子解析法-アンチセンス核酸の分子設計の試み
      著者名 : 村上 章、坂本隆、馬原淳, 小堀哲生
      出版社名 : 講談社サイエンティフィック
      出版年月 : 2007年07月
    • Various properties of polymeric carriers improve the transfection efficiency
      著者名 : A. Kobori
      出版年月 : 2006年12月
    • Solid-phase detection of RNA using bispyrene-modified RNA probe
      著者名 : A.Kobori
      出版年月 : 2006年11月
    • Properties of novel antisense oligonucleotides containing 2'-O-modified adenosine with a photo-reactive group
      著者名 : A.Kobori
      出版年月 : 2006年11月
    • Synthesis and cross-linking activities of oligodeoxy-nucleotides containing a 4-oxoalkenal group
      著者名 : A. Kobori; T. Kobuchi; M. Ikeda
      出版年月 : 2006年11月
    • The destabilization of polyplexes facilitates intranuclear transcription efficiency
      著者名 : A.Kobori
      出版年月 : 2005年11月
    • Synthesis of antisense oligonucleotides containing a photocleavable protecting group on a guanine base and their photoinduced duplex formation
      著者名 : A.Kobori
      出版年月 : 2005年11月
    • Synthesis and properties of photo-reactive antisense oligonucleotides containing 2'-O-psoralen-conjugated adenosine
      著者名 : A.kobori
      出版年月 : 2005年11月
    • Luminescence anisotropy-based detection of nucleic acids and proteins using long-lifetime Ru(II) complex as a luminescent label
      著者名 : A.Kobori
      出版年月 : 2005年11月
    • Solution structure of a small-molecular ligand complexed with CAG trinucleotide repeat DNA.
      著者名 : 8.,K. Nakatani; S. Hagihara; Y. Goto; A. Kobori; M. Hagihara; G. Hayashi; M. Kyo; M. Nomura; M. Mishima; C.Kojima
      出版年月 : 2005年09月
    • 蛍光分光法を用いたアンチセンス核酸のターゲット領域検索
      著者名 : 小堀哲生、
      出版年月 : 2005年05月

    科学研究費助成事業

    NO.研究種目研究課題交付年度
    若手研究(B)架橋型アンチセンス核酸による転写活性制御法の開発2007
    新規蛍光プローブを用いたRNA検出法の開発2006
    若手研究(B)架橋型アンチセンス核酸による転写活性制御法の開発2006
    その他ミスマッチ塩基対結合リガンド固定化SNP検出デバイスに関する研究2004


    © Kyoto Institute of Technology, © Media Fusion Co., Ltd.