志波 智生 

所属部署応用生物学系
職名教授
Last Updated :2021/09/16

プロフィール

取得学位

  • 修士(工学), 大阪大学, 1995年03月
  • 博士(薬学), 東京大学, 2000年03月

職歴(学外)

  • 2000年04月~2001年03月, 東京大学薬学部, 研究員
  • 2001年04月~2005年06月, 高エネルギー加速器研究機構, 博士研究員
  • 2005年06月~2006年03月, 東京大学大学院総合文化研究科, 助手
  • 2006年04月~2009年07月, 東京大学大学院総合文化研究科, 助教
  • 2009年08月~2010年03月, 東京大学大学院医学系研究科, 特任助教
  • 2010年04月~2011年06月, 東京大学大学院医学系研究科, 助教
  • 職歴(学内)

  • 2011年06月~2018年12月, 京都工芸繊維大学, 准教授
  • 2019年01月~, 京都工芸繊維大学, 教授
  • 教育活動

    担当授業

    • 有機化学Ⅰ
    • 生物化学Ⅰ
    • 構造生物工学特論
    • 生命分子構造科学
    • 生命分子構造機能学

    シラバス

    『シラバスシステムへのリンク』

    研究活動

    研究分野

    所属学会

      日本結晶学会, 日本生化学会, 日本寄生虫学会, 日本蛋白質科学会

    論文

    • Synthesis, biological, and photophysical studies of molecular rotor-based fluorescent Inhibitors of the Trypanosome Alternative Oxidase
      著者名 : Eduardo J. Cueto-Díaz , Godwin U. Ebiloma, Ibrahim A. Alfayez, Marzuq A. Ungogo, Leandro Lemgruber , M. Carmen González-García, Maria D. Giron, Rafael Salto , Francisco José Fueyo-González , Tomoo Shi
      掲載誌名 : Eur. J. Med. Chem
      出版年月 : 2021年08月
      巻・号・頁 : 220, 113470
    • Identification of 3,4-dihydro-2H,6H-pyrimido[1,2-c][1,3]benzothiazine-6-imine derivatives as novel selective inhibitors of Plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase
      著者名 : Endah Dwi Hartuti, Takaya Sakura, Mohammed S. O. Tagod, Eri Yoshida, Xinying Wang, Kota Mochizuki, Rajib Acharjee, Yuichi Matsuo, Fuyuki Tokumasu, Mihoko Mori, Danang Waluyo, Kazuro Shiomi, Tomoyoshi
      掲載誌名 : Int. J. Mol. Sci
      出版年月 : 2021年07月
      巻・号・頁 : 22, 7236
    • Structural basis for substrate specificity of L-methionine decarboxylase.
      著者名 : Atsushi Okawa, Tomoo Shiba, Masaya Hayashi, Yuki Onoue, Masaki Murota, Dan Sato, Junko Inagaki, Takashi Tamura, Shigeharu Harada and Kenji Inagaki
      掲載誌名 : Protein Science
      出版年月 : 2021年03月
      巻・号・頁 : 30(3), 663-677
    • Structural and biochemical features of Eimeria tenella dihydroorotate dehydrogenase, a potential drug target
      著者名 : Dan Sato, Endah Dwi Hartuti , Daniel Ken Inaoka, Takaya Sakura, Eri Amalia, Madoka Nagahama, Yukina Yoshioka, Naotoshi Tsuji, Tomoyoshi Nozaki, Kiyoshi Kita , Shigeharu Harada, Makoto Matsubayashi, Tomoo Shiba
      掲載誌名 : Genes
      出版年月 : 2020年12月
      巻・号・頁 : 11(12), 1468
    • Weak O2 binding and strong H2O2 binding at the non-heme diiron center of Trypanosome Alternative Oxidase
      著者名 : Sotaro Yamasaki, Mitsuo Shoji, Megumi Kayanuma, Vladimir Sladek, Daniel Ken Inaoka, Yuichi Matsuo, Tomoo Shiba, Luke Young, Anthony L. Moore, Kiyoshi Kita and Yasuteru Shigeta
      掲載誌名 : BBA - Bioenergetics
      出版年月 : 2020年12月
      巻・号・頁 : DOI: 10.1016/j.bbabio.2020.148356
    • The ASCT/SCS cycle fuels mitochondrial ATP and acetate production in Trypanosoma brucei
      著者名 : Kota Mochizuki, Daniel Ken Inaoka, Muriel Mazet, Tomoo Shiba, Keisuke Fukuda, Hana Kurasawa, Yoann Millerioux, Michael Boshart, Emmanuel O. Balogun, Shigeharu Harada, Kenji Hirayama, Frédéric Bringaud and Kiyoshi Kita
      掲載誌名 : BBA - Bioenergetics
      出版年月 : 2020年11月
      巻・号・頁 : 1861 (11), 148283
    • Oversized ubiquinones as molecular probes for structural dynamics of the ubiquinone reaction site in mitochondrial respiratory complex I
      著者名 : Shinpei Uno, Takahiro Masuya, Kyoko Shinzawa-Itoh, Jonathan Lasham, Outi Haapanen, Tomoo Shiba, Daniel Ken Inaoka, Vivek Sharma, Masatoshi Murai, Hideto Miyoshi
      掲載誌名 : J. Biol. Chem.
      出版年月 : 2020年01月
      巻・号・頁 : 295(8), 2449-2463
    • Discovery of trypanocidal coumarins with dual inhibition of both the glycerol kinase and alternative oxidase of Trypanosoma brucei brucei
      著者名 : Emmanuel Oluwadare Balogun, Daniel Ken Inaoka, Tomoo Shiba, Chiaki Tsuge, Benjamin May, Tomohiro Sato, Yasutoshi Kido, Takeshi Nara, Takashi Aoki, Teruki Honma, Akiko Tanaka, Masayuki Inoue, Shigeru Matsuoka, Paul A.M. Michels, Yoh-ichi Watanabe, Anthony L. Moore, Shigeharu Harada, Kiyoshi Kita
      掲載誌名 : FASEB J.
      出版年月 : 2019年09月
      巻・号・頁 : 2019 Sep 16:fj201901342R.
    • Identification of Plasmodium falciparum mitochondrial malate:quinone oxidoreductase inhibitors from the Pathogen Box
      著者名 : Xinying Wang, Yukiko Miyazaki, Daniel Ken Inaoka, Endah Dwi Hartuti, Yoh-Ichi Watanabe, Tomoo Shiba, Shigeharu Harada, Hiroyuki Saimoto, Jeremy Nicholas Burrows, Francisco Javier Gamo Benito, Tomoyoshi Nozaki, Kiyoshi Kita
      掲載誌名 : Genes
      出版年月 : 2019年06月
      巻・号・頁 : 10(6), 471
    • Insights into the ubiquinol/dioxygen binding and proton relay pathways of the alternative oxidase
      著者名 : Shiba T, Inaoka DK, Takahashi G, Tsuge C, Kido Y, Young L, Ueda S, Balogun EO, Nara T, Honma T, Tanaka A, Inoue M, Saimoto H, Harada S, Moore AL, Kita K
      掲載誌名 : BBA - Bioenergetics
      出版年月 : 2019年05月
      巻・号・頁 : 1860, 5, 375-382
    • Novel Characteristics of Mitochondrial Electron Transport Chain from Eimeria tenella
      著者名 : Makoto Matsubayashi, Daniel Ken Inaoka, Keisuke Komatsuya, Takeshi Hatta, Fumiya Kawahara, Kimitoshi Sakamoto, Kenji Hikosaka, Junya Yamagishi, Kazumi Sasai, Tomoo Shiba, Shigeharu Harada, Naotoshi Tsuji and Kiyoshi Kita
      掲載誌名 : Genes
      出版年月 : 2019年01月
      巻・号・頁 : 10, 29
    • SAR of 4-Alkoxybenzoic Acid Inhibitors of the Trypanosome Alternative Oxidase
      著者名 : Alejandro Meco-Navas, Godwin U. Ebiloma, Ana Martín-Domínguez, Irene Martínez-Benayas, Eduardo J. Cueto-Díaz, Amani Saud Alhejely, Emmanuel O. Balogun, Machi Saito, Miho Matsui, Natsumi Arai, Tomoo Shiba, Shigeharu Harada, Harry P. de Koning, and Christophe Dardonville
      掲載誌名 : ACS Med. Chem. Lett.
      出版年月 : 2018年09月
      巻・号・頁 : 9, 9, 923-928
    • Selective cytotoxicity of dihydroorotate dehydrogenase inhibitors to human cancer cells under hypoxia and nutrient-deprived conditions
      著者名 : Yukiko Miyazaki, Daniel K. Inaoka, Tomoo Shiba, Hiroyuki Saimoto, Takaya Sakura, Eri Amallia, Yasutoshi Kido, Chika Sakai, Mari Nakamura, Anthony L. Moore, Shigeharu Harada and Kiyoshi Kita
      掲載誌名 : Front. Pharmacol
      出版年月 : 2018年09月
      巻・号・頁 : 2018 Sep 4;9:997, doi: 10.3389/fphar.2018.00997.
    • Biochemical studies of membrane bound Plasmodium falciparum mitochondrial L-malate:quinone oxidoreductase, a potential drug target.
      著者名 : Endah Dwi Hartuti, Daniel Ken Inaoka, Keisuke Komatsuya, Yukiko Miyazaki, Russell J. Miller, Wang Xinying, Mohamad Sadikin, Erwahyuni Endang Prabandari, Danang Waluyo, Marie Kuroda, Eri Amalia, Yuichi Matsuo, Nuki B. Nugroho, Hiroyuki Saimoto, Amila Pramisandi, Yoh-Ichi Watanabe, Mihoko Mori, Kazuro Shiomi, Emmanuel Oluwadare Balogun, Tomoo Shiba, Shigeharu Harada, Tomoyoshi Nozaki, Kiyoshi Kita
      掲載誌名 : BBA - Bioenergetics
      出版年月 : 2018年03月
      巻・号・頁 : 1859, 191-200 (2018)
    • Ubiquinone binding site of yeast NADH dehydrogenase revealed by structures binding novel competitive- and mixed-type inhibitors
      著者名 : Tetsuo Yamasita, Daniel Ken Inaoka, Tomoo Shiba, Takumi Oohashi, So Iwata, Takao Yagii, Hiroaki Kosaka, Hideto Miyoshi, Shigeharu Harada, Kiyoshi Kita, Katsuya Hirano
      掲載誌名 : Scientific Reports
      出版年月 : 2018年02月
      巻・号・頁 : 8, Article number: 2427
    • Conjugates of 2,4-Dihydroxybenzoate and Salicylhydroxamate and Lipocations Display Potent Antiparasite Effects by Efficiently Targeting the Trypanosoma brucei and Trypanosoma congolense Mitochondrion.
      著者名 : Godwin U. Ebiloma, Teresa Díaz Ayuga, Lucía Abad Gil, Emmanuel O. Balogun, Anne Donachie, Daniel K. Inaoka, Tomoo Shiba, Shigeharu Harada, Kiyoshi Kita, Harry P. de Koning, Christophe Dardonville
      掲載誌名 : Eur. J. Med. Chem.
      出版年月 : 2018年02月
      巻・号・頁 : 150, 385-402
    • Glycerol Kinase of African Human Trypanosomes Possesses an Intrinsic Phosphatase Activity
      著者名 : Balogun EO, Inaoka DK, Shiba T, Tokuoka SM, Tokumasu F, Sakamoto K, Kido Y, Michels PAM, Watanabe Y, Harada S, Kita K
      掲載誌名 : BBA - General Subjects
      出版年月 : 2017年11月
      巻・号・頁 : 1861, 11A, 2830-2842
    • X-ray snapshots of a pyridoxal enzyme: a catalytic mechanism involving concerted [1,5]-hydrogen sigmatropy in methionine γ-lyase
      著者名 : Dan Sato, Tomoo Shiba, Tsuyoshi Karaki, Wataru Yamagata, Takashi Nakazawa, Tomoyoshi Nozaki, Shigeharu Harada
      掲載誌名 : Scientific Reports
      出版年月 : 2017年07月
      巻・号・頁 : 7, Article number: 4874
    • Expression, purification, and crystallization of type 1 isocitrate dehydrogenase from Trypanosoma brucei brucei
      著者名 : Xinying Wang, Daniel Ken Inaoka, Tomoo Shiba, Emmanuel Balogun, Stefan Allmann, Yoh-ichi Watanabe, Michael Boshart, Kiyoshi Kita, Shigeharu Harada
      掲載誌名 : Protein Expression and Purification
      出版年月 : 2017年07月
      巻・号・頁 : 138, 56-62
    • Structural and mechanistic insights into homocysteine degradation by a mutant of methionine γ-lyase based on substrate-assisted catalysis
      著者名 : Dan Sato, Tomoo Shiba, Shunsuke Yunoto, Kazuo Furutani, Mitsuki Fukumoto,Daizou Kudou, Takashi Tamura, Kenji Inagaki, Shigeharu Harada
      掲載誌名 : Protein Science
      出版年月 : 2017年06月
      巻・号・頁 : 26, 1224-1230
    • The hyperthermophilic cystathionine gamma-synthase from the aerobic crenarchaeon Sulfolobus tokodaii: expression, purification, crystallization and structural insights
      著者名 : Dan Sato, Tomoo Shiba, Sae Mizuno, Ayaka Kawamura, Shoko Hanada, Tetsuya Yamada, Mai Shinozaki, Masahiko Yanagitani, Takashi Tamura, Kenji Inagaki, Shigeharu Harada
      掲載誌名 : Acta Cryst. F
      出版年月 : 2017年03月
      巻・号・頁 : 73, 152-158
    • Conjugates of 2,4-Dihydroxybenzoate and Salicylhydroxamate and Lipocations Display Potent Anti-parasite Effects by Efficiently Targeting the Trypanosoma brucei and Trypanosoma congolense Mitochondrion
      著者名 : Francisco José Fueyo González, Godwin U. Ebiloma, Carolina Izquierdo García, Victor Bruggeman, José María Sánchez Villamañán, Anne Donachie, Emmanuel Oluwadare Balogun, Daniel Ken Inaoka, Tomoo Shiba, Shigeharu Harada, Kiyoshi Kita, Harry P. de Koning, Christophe Dardonville
      掲載誌名 : J. Med. Chem.
      出版年月 : 2017年02月
      巻・号・頁 : 60, 1509-1522
    • Open form inducer: a new approach for structure-based drug design
      著者名 : Daniel Ken Inaoka, Maiko Iida, Toshiyuki Tabuchi, Honma Teruki, Nayoung Lee, Satoshi Hashimoto, Shigeru Matsuoka, Takefumi Kuranaga, Kazuhito Sato, Tomoo Shiba, Kimitoshi Sakamoto, Emmanuel Oluwadare Balogun, Shigeo Suzuki, Takeshi Nara, Josmar Rodrigues da Rocha, Carlos Alberto Montanari, Akiko Tanaka, Masayuki Inoue, Shigeharu Harada, Kiyoshi Kita
      掲載誌名 : PLoS One
      出版年月 : 2016年11月
      巻・号・頁 : 11(11), e0167078
    • Structural Insights into the Molecular Design of Flutolanil Derivatives Targeted for Fumarate Respiration of Parasite Mitochondria
      著者名 : Daniel Ken Inaoka, Tomoo Shiba, Dan Sato, Emmanuel Oluwadare Balogun, Tsuyoshi Sasaki, Madoka Nagahama, Masatsugu Oda, Shigeru Matsuoka, Junko Ohmori, Teruki Honma, Masayuki Inoue, Kiyoshi Kita, Shigeharu Harada
      掲載誌名 : Int. J. Mol. Sci.
      出版年月 : 2015年07月
      巻・号・頁 : 16(7), 15287-15308
    • Pharmacophore Modeling for Anti-Chagas Drug Design Using the Fragment Molecular Orbital Method
      著者名 : Ryunosuke Yoshino, Nobuaki Yasuo, Inaoka Daniel Ken, Yohsuke Hagiwara, Kazuki Ohno, Masaya Orita, Masayuki Inoue, Tomoo Shiba, Shigeharu Harada, Teruki Honma, Balogun Emmanuel Oluwadare, Rocha Josmar Rodrigues, Montanari Carlos Alberto, Kiyoshi Kita, Masakazu Sekijima
      掲載誌名 : PLOS ONE
      出版年月 : 2015年05月
      巻・号・頁 : 10(5), e0125829
    • Molecular basis for the reverse reaction of African human trypanosomes glycerol kinase
      著者名 : Emmanuel Oluwadare Balogun, Daniel Ken Inaoka, Tomoo Shiba, Yasutoshi Kido, Chiaki Tsuge, Takeshi Nara, Takashi Aoki, Teruki Honma, Akiko Tanaka, Masayuki Inoue, Shigeru Matsuoka, Paul A.M. Michels, Kiyoshi Kita, Shigeharu Harada
      掲載誌名 : Mol Microbiol.
      出版年月 : 2014年12月
      巻・号・頁 : 94 (6), 1315-1329
    • Probing the ubiquinol-binding site of recombinant Sauromatum guttatum alternative oxidase expressed in E. coli membranes through site-directed mutagenesis
      著者名 : Luke Young, Ben May, Alice Pendlebury-Watt, Julia Shearman, Catherine Elliott, Mary S. Albury, Shigeharu Harada, Daniel Ken Inaoka, Shigeharu Harada, Kiyoshi Kita, Anthony L. Moore
      掲載誌名 : Biochimica et Biophysica Acta
      出版年月 : 2014年07月
      巻・号・頁 : 1837, 1219-1225
    • Anemia amelioration by lactose infusion during trypanosomosis could be associated with erythrocytes membrane de-galactosylation
      著者名 : Emmanuel Oluwadare Balogun, Joshua Balogun, Sadiq Yusuf, Hajia Inuwa, Iliya Ndams, Paul Sheridan, Daniel Inaoka, Tomoo Shiba, Shigeharu Harada, Kiyoshi Kita, King Esievo, Andrew Nok
      掲載誌名 : Veterinary Parasitology
      出版年月 : 2014年01月
      巻・号・頁 : 199, 259-263
    • Biochemical characterization of highly active Trypanosoma brucei gambiense glycerol kinase, a promising drug target
      著者名 : Emmanuel Oluwadare Balogun, Daniel Ken Inaoka, Tomoo Shiba, Yasutoshi Kido, Takeshi Nara, Takashi Aoki, Teruki Honma, Akiko Tanaka, Masayuki Inoue, Shigeru Matsuoka, Paul AM. Michels, Shigeharu Harada, Kiyoshi Kita
      掲載誌名 : J. Biochemistry
      出版年月 : 2013年07月
      巻・号・頁 : 154, 77-84
    • Structure of the trypanosome cyanide-insensitive alternative oxidase
      著者名 : Tomoo Shiba, Yasutoshi Kido, Kimitoshi Sakamoto, Daniel Ken Inaoka, Chiaki Tsuge, Ryoko Tatsumi, Gen Takahashi, Emmanuel Oluwadare Balogun, Takeshi Nara, Takashi Aoki, Teruki Honma, Akiko Tanaka, Masayuki Inoue, Shigeru Matsuoka, Hiroyuki Saimoto, Anthony L. Moore, Shigeharu Harada, Kiyoshi Kita
      掲載誌名 : Proc. Natl. Acad. Sci. USA
      出版年月 : 2013年03月
      巻・号・頁 : 110, 4580-4585
    • Structures of cyanobacteriochromes from phototaxis regulators AnPixJ and TePixJ reveal general and specific photoconversion mechanism
      著者名 : Rei Narikawa, Takami Ishizuka, Norifumi Muraki, Tomoo Shiba, Genji Kurisu, Masahiko Ikeuchi
      掲載誌名 : Proc. Natl. Acad. Sci. USA
      出版年月 : 2013年01月
      巻・号・頁 : 110, 918-923
    • Identification and Characterization of Sialidase-Like Activity in the Developmental Stages of Amblyomma variegatum.
      著者名 : Audu J. Natala, Emmanuel O. Balogun, Joshua A. B. Balogun, Hajiya M. Inuwa, Andrew J. Nok, Tomoo Shiba, Shigeharu Harada, Kiyoshi Kita, Rowland I. S. Agbede, King A. N. Esievo
      掲載誌名 : J. of Med. Entomol.
      出版年月 : 2013年01月
      巻・号・頁 : 50, 85-93
    • The Role of Amino Acid Residues in the Active Site of L-Methionine γ-lyase from Pseudomonas putida
      著者名 : Mitsuki Fukumoto, Daizou Kudou, Shouko Murano, Tomoo Shiba, Dan Sato, Takashi Tamura, Shigeharu Harada, Kenji Inagaki
      掲載誌名 : Biosci. Biotechnol. Biochem.
      出版年月 : 2012年07月
      巻・号・頁 : 76, 1275?1284
    • Crystal structure of mitochondrial quinol-fumarate reductase from the parasitic nematode Ascaris suum
      著者名 : Hironari Shimizu, Arihiro Osanai, Kimitoshi Sakamoto, Tomoo Shiba, Daniel Ken Inaoka, Shigeharu Harada, Kiyoshi Kita
      掲載誌名 : J. Biochemistry
      出版年月 : 2012年06月
      巻・号・頁 : 151, 589-592
    • A conserved lysine residue in the crenarchaea-specific loop is important for the crenarchaeal splicing endonuclease activity
      著者名 : Maho Okuda, Tomoo Shiba, Daniel-Ken Inaoka, Kiyoshi Kita, Genji Kurisu, Shigeru Mineki, Shigeharu Harada, Yoh-ichi Watanabe, and Shigeo Yoshinari
      掲載誌名 : J. Mol. Biol.
      出版年月 : 2011年01月
      巻・号・頁 : Vol. 405, pp. 92-104
    • Crystallization and preliminary X-ray structural analysis of nucleoside triphosphate hydrolases from Neospora caninum and Toxoplasma gondii
      著者名 : Kazuaki Matoba, Tomoo Shiba, Tsutomu Takeuchi, L. David Sibley, Makiko Seiki, Fumi Kikyo, Toshio Horiuchi, Takashi Asai and Shigeharu Harada
      掲載誌名 : Acta Cryst. F
      出版年月 : 2010年11月
      巻・号・頁 : Vol. 66, pp. 1445-1448
    • Asymmetric Dimeric Structure of Ferredoxin-NAD(P)+ Oxidoreductase from the Green Sulfur Bacterium Chlorobaculum tepidum: Implications for Binding Ferredoxin and NADP+
      著者名 : Norifumi Muraki, Daisuke Seo, Tomoo Shiba, Takeshi Sakurai, Genji Kurisu
      掲載誌名 : J. Mol. Biol.
      出版年月 : 2010年06月
      巻・号・頁 : Vol. 401, pp. 403-414
    • X-ray crystal structure of the light-independent protochlorophyllide reductase
      著者名 : Norifumi Muraki, Jiro Nomata, Kozue Ebata, Tadashi Mizoguchi, Tomoo Shiba, Hitoshi Tamiaki, Genji Kurisu, Yuichi Fujita
      掲載誌名 : Nature
      出版年月 : 2010年05月
      巻・号・頁 : Vol. 465, pp. 110-115
    • Overproduction, purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of Trypanosoma brucei gambiense glycerol kinase
      著者名 : Emmanuel Oluwadare Balogun, Daniel Ken Inaoka, Yasutoshi Kido, Tomoo Shiba, Takeshi Nara, Takashi Aoki, Teruki Honma, Akiko Tanaka, Masayuki Inoue, Shigeru Matsuoka, Paul AM. Michels, Shigeharu Harada, Kiyoshi Kita
      掲載誌名 : Acta Cryst. F
      出版年月 : 2010年03月
      巻・号・頁 : Vol. 66, pp. 304-308
    • Crystallization and preliminary crystallographic analysis of cyanide-insensitive alternative oxidase from Trypanosoma brucei brucei
      著者名 : Yasutoshi Kido, Tomoo Shiba, Daniel Ken Inaoka, Kimitoshi Sakamoto, Takeshi Nara, Takashi Aoki, Teruki Honma, Akiko Tanaka, Masayuki Inoue, Shigeru Matsuoka, Anthony Moore, Shigeharu Harada and Kiyoshi Kita
      掲載誌名 : Acta Cryst. F
      出版年月 : 2010年03月
      巻・号・頁 : Vol. 66, pp. 275-278
    • Functional importance of Crenarchaea-specific extra-loop revealed by an X-ray structure of a hetero-tetrameric crenarchaeal splicing endonuclease
      著者名 : Shigeo Yoshinari, Tomoo Shiba, Daniel-Ken Inaoka, Takashi Itoh, Genji Kurisu, Shigeharu Harada, Kiyoshi Kita and Yoh-ichi Watanabe
      掲載誌名 : Nucleic. Acids Res.
      出版年月 : 2009年08月
      巻・号・頁 : Vol. 37, pp. 4787-4798
    • Crystallization and preliminary X-ray studies of the chromophore-binding domain of cyanobacteriochrome AnPixJ from Anabaena sp. PCC 7120
      著者名 : Rei Narikawa, Norifumi Muraki, Tomoo Shiba, Masahiko Ikeuchi, Genji Kurisu
      掲載誌名 : Acta Cryst. F
      出版年月 : 2009年02月
      巻・号・頁 : Vol. 65, pp. 159-162
    • Structures of Trypanosoma cruzi Dihydroorotate Dehydrogenase Complexed with Substrates and Products: Atomic Resolution Insights into Mechanisms of Dihydroorotate Oxidation and Fumarate Reduction
      著者名 : Daniel Ken Inaoka, Kimitoshi Sakamoto, Hironari Shimizu, Tomoo Shiba, Genji Kurisu, Takeshi Nara, Takashi Aoki, Kiyoshi Kita and Shigeharu Harada
      掲載誌名 : Biochemistry
      出版年月 : 2008年10月
      巻・号・頁 : Vol. 47, pp. 10881-10891
    • Crystallization and preliminary X-ray studies of ferredoxin-NAD(P)+ reductase from Chlorobium tepidum
      著者名 : Norifumi Muraki, Daisuke Seo, Tomoo Shiba, Takeshi Sakurai, Genji Kurisu
      掲載誌名 : Acta Cryst. F
      出版年月 : 2008年03月
      巻・号・頁 : Vol. 64, pp. 186-189
    • Molecular basis for autoregulatory interaction between GAE domain and hinge region of GGA1
      著者名 : Michio Inoue, Tomoo Shiba, Kentaro Ihara, Yusuke Yamada, Satoshi Hirano, Hironari Kamikubo, Mikio Kataoka, Masato Kawasaki, Ryuichi Kato, Kazuhisa Nakayama, Soichi Wakatsuki
      掲載誌名 : Traffic
      出版年月 : 2007年05月
      巻・号・頁 : Vol. 8, pp. 904-913
    • Crystal structure of GlcAT-S, a human glucuronyltransferase, involved in the biosynthesis of the HNK-1 carbohydrate epitope
      著者名 : Tomoo Shiba, Shinako Kakuda, Masaji Ishiguro, Ippei Morita, Shogo Oka, Toshisuke Kawasaki, Soichi Wakatsuki, Ryuichi Kato
      掲載誌名 : Proteins
      出版年月 : 2006年11月
      巻・号・頁 : Vol. 65, pp. 499-508
    • Structural basis for Rab11-dependent membrane recruitment of family of Rab11-interacting protein 3 (FIP3)/Arfophilin-1
      著者名 : Tomoo Shiba, Hiroshi Koga, Hye-Won Shin, Masato Kawasaki, Ryuichi Kato, Kazuhisa Nakayama, Soichi Wakatsuki
      掲載誌名 : Proc. Natl. Acad. Sci. USA
      出版年月 : 2006年10月
      巻・号・頁 : Vol. 103, pp. 15416-15421
    • Structural Basis of Carbohydrate Transfer Activity by Human UDP-GalNAc: Polypeptide alpha-N-Acetylgalactosaminyltransferase (pp-GalNAc-T10)
      著者名 : Tomomi Kubota, Tomoo Shiba, Shigemi Sugioka, Sanae Furukawa, Hiromichi Sawaki,, Ryuich Kato, Soichi Wakatsuki, Hisashi Narimatsu
      掲載誌名 : J. Mol. Biol.
      出版年月 : 2006年06月
      巻・号・頁 : Vol. 359, pp. 708-727
    • Structural basis for recognition of ubiquitinated cargo by Tom1-GAT domain
      著者名 : Masato Akutsu, Masato Kawasaki, Yohei Katoh, Tomoo Shiba, Yoshiki Yamaguchi, Ryuichi Kato, Koichi Kato, Kazuhisa Nakayama, Soichi Wakatsuki
      掲載誌名 : FEBS letters
      出版年月 : 2005年10月
      巻・号・頁 : Vol. 579, pp. 5385-5391
    • Molecular mechanism of ubiquitin recognition by GGA3 GAT domain
      著者名 : Masato Kawasaki, Tomoo Shiba, Yoko Shiba, Yoshiki Yamaguchi, Naohiro Matsugaki, Noriyuki Igarashi, Mamoru Suzuki, Ryuichi Kato, Koichi Kato, Kazuhisa Nakayama, Soichi Wakatsuki
      掲載誌名 : Genes to Cells
      出版年月 : 2005年07月
      巻・号・頁 : Vol. 10, pp. 639-654
    • Structure determination of GGA-GAE and gamma1-ear in complex with peptides: crystallization of low affinity complexes in membrane traffic
      著者名 : Yusuke Yamada, Michio Inoue, Tomoo Shiba, Masato Kawasaki, Ryuichi Kato, Kazuhisa Nakayama, Soichi Wakatsuki
      掲載誌名 : Acta Cryst. D
      出版年月 : 2005年06月
      巻・号・頁 : Vol. 61, pp. 731-736
    • Insights into the phosphoregulation of gamma-secretase sorting signal by the VHS domain of GGA1
      著者名 : Tomoo Shiba, Satoshi Kametaka, Masato Kawasaki, Masahiro Shibata, Satoshi Waguri, Yasuo Uchiyama, Soichi Wakatsuki
      掲載誌名 : Traffic
      出版年月 : 2004年06月
      巻・号・頁 : Vol. 5, pp. 437-448
    • Structural basis for acceptor substrate recognition of a human glucuronyltransferase, GlcAT-P, an enzyme critical in the biosynthesis of the carbohydrate epitope HNK-1
      著者名 : Shinako Kakuda, Tomoo Shiba, Masaji Ishiguro, Hideki Tagawa, Shogo Oka, Yasuhiro Kajiwara, Toshisuke Kawasaki, Soichi Wakatsuki, Ryuichi Kato
      掲載誌名 : J. Biol. Chem.
      出版年月 : 2004年05月
      巻・号・頁 : Vol. 279, pp. 22693?22703
    • GAT (GGA and Tom1) domain responsible for ubiquitin binding and ubiquitination
      著者名 : Yoko Shiba, Yohei Katoh, Tomoo Shiba, Kaori Yoshino, Hiroyuki Takatsu, Hiromi Kobayashi, Hye-Won Shin, Soichi Wakatsuki, Kazuhisa Nakayama
      掲載誌名 : J. Biol. Chem.
      出版年月 : 2004年02月
      巻・号・頁 : Vol. 279, pp. 7105?7111
    • Molecular mechanism of membrane recruitment of GGA by ARF in lysosomal protein transport
      著者名 : Tomoo Shiba, Masato Kawasaki, Hiroyuki Takatsu, Terukazu Nogi, Naohiro Matsugaki, Noriyuki Igarashi, Mamoru Suzuki, Ryuichi Kato, Kazuhisa Nakayama, Soichi Wakatsuki
      掲載誌名 : Nature Struct. Biol.
      出版年月 : 2003年05月
      巻・号・頁 : Vol. 10, pp. 386-393
    • Structural basis for the accessory protein recruitment by the gamma-adaptin ear domain
      著者名 : Terukazu Nogi, Yoko Shiba, Masato Kawasaki, Tomoo Shiba, Naohiro Matsugaki, Noriyuki Igarashi, Mamoru Suzuki, Ryuichi Kato, Hiroyuki Takatsu, Kazuhisa Nakayama, Soichi Wakatsuki
      掲載誌名 : Nature Struct. Biol.
      出版年月 : 2002年07月
      巻・号・頁 : Vol. 9, pp. 527-531
    • Structural basis for recognition of acidic-cluster dileucine sequence by GGA1
      著者名 : Tomoo Shiba, Hiroyuki Takatsu, Terukazu Nogi, Naohiro Matsugaki, Masato Kawasaki, Noriyuki Igarashi, Mamoru Suzuki, Ryuichi Kato, Thomas Earnest, Kazuhisa Nakayama, Soichi Wakatsuki
      掲載誌名 : Nature
      出版年月 : 2002年02月
      巻・号・頁 : Vol. 415, pp. 937-941
    • Crystallization and preliminary X-ray analysis of a bacterial lysozyme produced by Streptomyces globisporus
      著者名 : Tomoo Shiba, Shigeharu Harada, Hajime Sugawara, Hisashi Naitow, Yasushi Kai and Yoshinori Satow
      掲載誌名 : Acta Cryst. D
      出版年月 : 2000年11月
      巻・号・頁 : Vol. 56, pp. 1462-1463
    • A novel mode of target recognition suggested by the 2.0 Å structure of holo S100B from bovine brain
      著者名 : Hiroyoshi Matsumura, Tomoo Shiba, Tsuyoshi Inoue, Shigeharu Harada and Yasushi Kai
      掲載誌名 : Structure
      出版年月 : 1998年02月
      巻・号・頁 : Vol. 6, pp. 233-241

    著書等

    • Structure and Mechanism of Action of the Alternative Quinol Oxidases
      出版年月 : 2016年06月
    • 微生物からの贈り物アスコフラノン - アフリカ睡眠病からがん細胞まで -
      著者名 : 志波 智生
      出版年月 : 2014年11月
    • 希少疾病のアカデミア創薬 ? グローバルオーファンドラッグ創成をめざして ?
      著者名 : 志波 智生
      出版社名 : 32, 210-215
      出版年月 : 2014年02月
    • The alternative oxidases: simple oxidoreductase proteins with complex functions
      著者名 : Tomoo Shiba
      出版年月 : 2013年10月
    • アフリカ睡眠病治療薬の候補化合物と標的タンパク質との複合体構造
      著者名 : 志波 智生
      出版年月 : 2013年08月
    • Unraveling the Heater: New Insights into the Structure of the Alternative Oxidase
      著者名 : Anthony L. Moore, Tomoo Shiba, Luke Young, Shigeharu Harada, Kiyoshi Kita and Kikukatsu Ito
      出版年月 : 2013年04月
    • 結晶化条件のスクリーニング
      著者名 : 志波 智生
      出版年月 : 2008年05月
    • 結晶化条件の最適化
      著者名 : 志波 智生
      出版年月 : 2008年05月
    • FIP3による低分子量GTPase Rab11の認識機構の研究
      著者名 : 志波 智生
      出版年月 : 2007年08月
    • 細胞内小胞輸送およびタンパク質の翻訳後修飾のX線結晶構造解析による研究
      著者名 : 志波 智生
      出版年月 : 2006年05月
    • HNK-1糖鎖の生合成に必須な糖転移酵素GlcAT-Pのユニークな糖鎖基質認識機構
      著者名 : 志波 智生
      出版年月 : 2005年02月
    • 生命科学から創薬へのイノベーション 第7章
      著者名 : 北潔, 志波 智生, 稲岡ダニエル健, 原田繁春
      出版社名 : 南山堂
      出版年月 : 2014年

    受賞

    NO.受賞年月受賞名授与者
    2005年12月日本結晶学会進歩賞


    © Kyoto Institute of Technology, © Media Fusion Co., Ltd.